哈工大深圳国际商学院作为校本部和深圳校区的二级单位，2018年经哈尔滨工业大学校长办公会通过成立。旨在机制和制度上进行创新，充分利用学科交叉凝练、融合新的方向，将市场、企业和政府紧密结合。

哈工大深圳国际商学院办公区位于深圳大学城哈尔滨工业大学（深圳）F栋，先后设立EMBA、MBA、MPA、EDP、MPAcc中心，负责完成深圳校区相关专业非全日制研究生的招生与培养工作。截止到2021年12月，已授予高级工商管理非全日制研究生学位49人、工商管理非全日制研究生学位242人。目前，共计11位员工长驻深圳工作。